Transport zwierząt musi być właściwie zorganizowany i przede wszystkim bezpieczny dla przewożonych zwierząt. Przepisy szczegółowo opisują zasady transportu zwierząt, czas realizacji oraz wymagania pojazdów wykonujących transport. W przypadku transportu żywych zwierząt najważniejsze są względy
etyczne, dlatego podczas transportu należy zapewnić im bezpieczne i humanitarne warunki.

Jeżeli czas transportu zwierząt przekracza 8 godzin zwierzęta powinny być pojone i karmione. Transportować można tylko zwierzęta zdrowe, zbadane przez lekarza weterynarii.

Nadawca zwierząt wyznacza konwojenta, który będzie obecny podczas dozorowania przewozu zwierząt oraz opiekowania się nimi podczas przewozu.

W przypadku, gdy konwojent nie został wyznaczony to przewoźnik może sam podjąć się transportu zwierząt pod warunkami:

• musi posiadać odpowiednie kwalifikacje.
• jeśli nadawca zadbał o obecność konwojenta w miejscach i na czas postoju.
• jeśli zwierzęta są przewożone w bezpiecznych i odpowiednio wentylowanych kontenerach, które zwierają wodę i paszę w ilość wystarczającej na czas dwukrotnie dłuższy niż przewidywany do przebycia, powinny być one umieszczone w pojemnikach , które są zabezpieczone przez przewróceniem.

Zezwolenie dla przewoźnika nie jest wymagane, gdy:

• przewóz zwierząt nie jest związany z prowadzoną działalnością, np.: przewóz własnego konia, własnym środkiem transportu w celach rekreacyjnych; przewóz w celach niehandlowych zwierząt domowych towarzyszących podróżnym;
• transport zwierząt odbywa się z polecenia lekarza weterynarii bezpośrednio do lub z gabinetów lub klinik weterynaryjnych;
• przewóz jest dokonywany na maksymalną odległość 65 km, liczoną od miejsca wyjazdu do miejsca przeznaczenia;
• transport zwierząt dokonywany jest przez rolników wykorzystujących pojazdy rolnicze lub należące do nich środki transportu, w przypadku, gdy warunki geograficzne wymagają transportu niektórych gatunków zwierząt w celu sezonowego wypasu;
• transport zwierząt dokonywany jest przez rolników wykorzystujących pojazdy rolnicze lub należące do nich środki transportu na odległość mniejszą niż 50 km od ich gospodarstwa.

Nie wolno przewozić zwierząt ciężarnych w końcowej fazie ciąży i w tygodniu następującym po porodzie oraz zwierząt bardzo młodych urodzonych dwie doby przed planowanym transportem (w przypadku cieląt do 10 dni, świń poniżej 3 tygodni, jagniąt poniżej tygodnia) – chyba że trasa jest krótsza niż 100 km.

Pojazdy do transportu zwierząt muszą być regularnie czyszczone i dezynfekowane.